Фамилия Гуняшин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Гуняшин, то есть «сын Гуняши» или «человек из рода Гуняши». Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Гуняша.

Само имя Гуняша — производное от слова «гуня». В старых русских говорах «гуня» означала ветхую, худую одежду, рубище, а также могло относиться к небрежно одетому человеку. В этом случае прозвище Гуняша давали тому, кто ходил в обносках или не следил за нарядом. Однако есть и другая версия: в некоторых диалектах «гуня» — это деталь ткацкого станка или, реже, название короткой верхней одежды. Тогда прозвище могло закрепиться за ткачом или портным. Обе версии правдоподобны, так как прозвища по одежде и ремеслу были в ходу у крестьян и ремесленников.

Менее вероятно, но возможно, что Гуняша — уменьшительная форма от крестильного имени Гурий (в народном произношении Гуня). Однако суффикс -ша в русской антропонимии чаще образовывал прозвища от нарицательных слов, чем от церковных имён. Поэтому связь с одеждой или ремеслом выглядит более естественной.

Фамилия Гуняшин — довольно редкая. Её географическое распространение тяготеет к северным и центральным областям России, где диалектное слово «гуня» было в активном употреблении. Встречаются варианты написания с одной «ш» — Гунясин, но это скорее исключение, чем норма. Среди однокоренных фамилий — Гуня, Гуняев, Гунькин, Гунько, все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами, характерными для разных регионов.

Социально предки носителей фамилии Гуняшин, скорее всего, относились к крестьянскому или посадскому сословию. Фамилии на -ин в этой среде часто фиксировали прозвище главы семьи, нередко ироничное или бытовое. Так что Гуняшин — это фамилия-характеристика, которая могла закрепиться за человеком, получившим прозвище по своей внешности или занятию.