Фамилия Гутуева — редкий случай в русской ономастике: она образована не от славянской основы, а от тюркского или кавказского корня, и при этом оформлена по русской словообразовательной модели. Чтобы понять её происхождение, нужно смотреть не на суффикс, а на корень.

Основа «Гут» или «Гуту» восходит к тюркским языкам, где слово «гут» (gut) означает «счастье», «благополучие» или «душа». В карачаево-балкарском, кумыкском и ногайском языках «гут» — это и «душа», и «животное» (скот как мерило достатка). В осетинском языке есть близкое по звучанию «гъуд» — «сердце», «душа». Таким образом, прозвище Гутуй (или Гуту) могли дать человеку счастливому, удачливому, либо тому, кто был душевным и отзывчивым. Менее вероятна, но возможна связь с арабским «гут» (غوث) — «помощь», «спасение», что давало бы прозвище «спаситель» или «заступник».

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Гутуев — это «сын Гутуя» или «из рода Гутуя». Поскольку фамилия не заканчивается на типично русские «-ов» (после твёрдого согласного) или «-ин», а использует «-ев» (после мягкого или йотированного звука), исходное прозвище звучало как Гутуй. Такая модель характерна для фамилий, возникших у народов Северного Кавказа и Поволжья, которые в XIX–XX веках получали русские паспорта и фамилии по отчеству.

Географически Гутуевы чаще всего встречаются среди ингушей, чеченцев, осетин и кумыков. В Ингушетии и Чечне фамилия Гутуев (женская форма — Гутуева) считается довольно старой, известна с XIX века. В русских переписных книгах эта фамилия практически не встречается — она вошла в обиход уже в советское время, когда национальные окраины массово получали паспорта с унифицированными фамилиями.

Таким образом, предки Гутуевых — скорее всего, горцы Северного Кавказа, носившие прозвище Гутуй («счастливый» или «душевный»). Фамилия не имеет отношения к русским крестьянским или дворянским фамилиям, а её корень указывает на тюркскую или кавказскую языковую среду.