Фамилия Игнатоля — редкий случай, когда фамилия образована не от полного имени, а от его уменьшительно-ласкательной или просторечной формы. В основе лежит имя Игнат (каноническая церковная форма — Игнатий, от латинского ignis — «огонь»). К имени добавили суффикс -оля, характерный для южнорусских, украинских и белорусских говоров. В этих регионах так образовывали прозвища и домашние имена: например, от Михаил — Михоля, от Павел — Паволя, от Григорий — Грицоля. Игнатоля — «маленький Игнат» или «сын Игната», но не в прямом смысле, а как прозвище, которое со временем закрепилось за родом.

Словообразовательная модель здесь необычна: суффикс -оля не так часто встречается в русских фамилиях, как, скажем, -ов или -ин. Обычно такие формы оставались прозвищами, но в данном случае они стали фамилией без дополнительного суффикса принадлежности. Это так называемая «усечённая» или «прозвищная» фамилия, которая не склоняется как прилагательное (Игнатоля, а не Игнатолин) и ведёт себя как существительное мужского рода. Такое явление типично для западнорусских земель и особенно для украинского ономастикона, где фамилии на -оля (Бондаря, Коваля, Шевченко) — массовое явление.

Географически фамилия Игнатоля, скорее всего, берёт начало в Черниговской, Киевской или Полтавской губерниях, а также в смежных областях современной России (Брянская, Курская). В этих краях имя Игнат было распространённым, а уменьшительные формы на -оля — естественной речевой нормой. Предок-носитель мог быть крестьянином или казаком, которого в быту звали Игнатолей, чтобы отличить от других Игнатов в селе. Позже это прозвище перешло к детям и внукам, утратив уменьшительный оттенок и став родовым знаком.

Спорных версий происхождения практически нет. Корень прозрачен, суффикс однозначно указывает на уменьшительную форму. Единственное, что может сбить с толку, — внешнее сходство с итальянскими фамилиями (например, Иньятоля), но это случайное совпадение. Русская фамилия Игнатоля — чисто славянская, без иноязычных примесей, и её разбор укладывается в классические схемы восточнославянской антропонимики, описанные в работах Б. Унбегауна и В. Никонова.