Фамилия Исенин звучит на слух как поэтическая вариация, но её корни прозаичнее и глубже. В основе фамилии лежит полное крестильное имя Иса (Иосиф), которое в народной русской традиции давало целый веер производных форм: Исей, Исеня, Исай. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Исенин, то есть потомок Исени, человека, которого в быту звали уменьшительно-ласкательно Исеня.

Спорный момент — возможная связь с фамилией Есенин. Фонетически они близки, но не идентичны. Версия о том, что Исенин — это диалектный вариант той же фамилии, где «ять» перешёл в «и» (как в словах «сино» вместо «сено»), существует. Однако надёжнее считать их самостоятельными образованиями от разных основ: Есенин — от Есеня (форма имени Есений или от «есень» — осень), а Исенин — от Исеня (от Иса/Иосиф).

Географически фамилия редкая и не имеет ярко выраженного «гнезда» расселения, как, например, рязанские Есенины. Встречается разрозненно в центральных областях России и Поволжье, что типично для фамилий, образованных от нечастых просторечных форм крестильных имён. В документах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Исеня, но в фамилию оно оформилось уже после отмены крепостного права, когда массово закреплялись уличные прозвания.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: основа (Исен-) + патронимический суффикс -ин. Это типичная «русская» фамилия, в отличие от «польских» на -ский или «украинских» на -енко. Предок носителя Исенина, скорее всего, был простым крестьянином или ремесленником, которого в деревне знали как Исеню — и это прозвище перешло к детям и внукам как официальная фамилия.