Фамилия Иткинин — одна из тех, что образована от женского имени, а не от мужского. Это сразу указывает на её особое место в ряду патронимических фамилий. В основе лежит еврейское женское имя Юдифь (Jehudith), которое переводится как «иудейка». От него через обиходные формы Итке, Ита и уменьшительные суффиксы пошли Иткин, Итин, Итлин, Иткис, Иткинсон — и, наконец, Иткинин с русским патронимическим суффиксом -ин.

К имени Юдифь прикреплена яркая ветхозаветная история. Речь о второканонической «Книге Юдифи»: молодая и богобоязненная вдова из города Ветилуя, когда в Иудею вторглась армия Навуходоносора под командованием полководца Олоферна, не стала ждать осады. Она надела лучшие одежды, взяла служанку, пришла в стан врага и обманом вошла в доверие к Олоферну. В одну из ночей, когда тот уснул пьяным, Юдифь отрезала ему голову и вернулась в город. Армия без полководца разбежалась, город был спасён, а Юдифь до конца жизни соблюдала обет безбрачия. Этот сюжет веками оставался популярным в европейском искусстве, но для носителей фамилии Иткинин он — не просто легенда, а прямой ключ к происхождению.

Модель образования у фамилии двойная. Сначала имя Юдифь (Jehudith) в идише и разговорной речи перешло в краткую форму Итке или Ита. Затем от неё через суффикс -ин (указывающий на принадлежность: «чей?» — Иткинин) появилась фамилия. Суффикс -ин в русской ономастике типичен для обозначения родства: чей сын, чья дочь. Но в данном случае он прикреплён к женскому имени, что встречается реже, чем к мужскому, и говорит о том, что предок носителя фамилии был назван по матери или по бабушке — возможно, в ситуации, когда женщина играла ключевую роль в семье или была вдовой, как и её библейская тёзка.

В географическом плане фамилия Иткинин не принадлежит к числу широко распространённых. Она встречается в среде еврейского населения бывшей черты оседлости, преимущественно на территориях современных Украины, Беларуси и Литвы. В дореволюционных документах можно найти варианты написания, которые тогда не были строго закреплены: Иткинин, Иткинын, Иткевич. Современная орфография закрепилась уже в советских паспортных столах.

Отдельно стоит сказать о родственных фамилиях. Итин, Иткин, Итлин, Иткис, Иткинсон — все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксами, которые указывают на разные языковые влияния. Например, -сон в Иткинсон — это типичный для ашкеназских евреев скандинавско-немецкий суффикс «сын», а -ис в Иткис — славянизированное окончание, характерное для польских и украинских земель. Иткинин же остаётся наиболее «русифицированным» вариантом, потому что суффикс -ин здесь полностью совпадает с русской патронимической моделью.