Фамилия Ивахин образована от уменьшительной формы крестильного имени Иван. В русской народной среде имя Иван, восходящее к каноническому Иоанн (с древнееврейского — «милость Божья»), дало огромное количество производных форм. Одна из них — Иваха — и легла в основу фамилии. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ивахин буквально значит «сын Ивахи» или «потомок Ивахи».

Стоит обратить внимание на редкий для фамилий этого корня суффикс -ах-. Обычно от имени Иван образовывали фамилии через суффиксы -ов/-ев (Иванов, Иванков) или -ин (Иванин, Ивашин). Форма на -ах- встречается реже и характерна для северных и центральных говоров, где уменьшительные имена вроде Иваха, Петряха, Митяха бытовали особенно широко. Это делает фамилию Ивахин нестандартной среди однокоренных — она выделяется на фоне массовых Ивановых и Иваниных.

В писцовых книгах XVI–XVII веков можно встретить упоминания крестьян и посадских людей с именем Иваха: например, в новгородских и вятских документах. Значит, фамилия могла закрепиться в тех же регионах. Позже она распространилась шире, но её концентрация до сих пор заметна в Вологодской, Кировской и Архангельской областях.

По сословному происхождению Ивахины в основном крестьяне и мещане. В дворянских родословных книгах фамилия не зафиксирована, что типично для образований от простонародных уменьшительных форм. Исключения редки и связаны с поздним получением дворянства по выслуге — такие случаи единичны и не меняют общей картины.