Фамилия Иванниов — один из тех редких случаев, когда двойное «н» в корне не случайность, а ключ к происхождению. В русской ономастике фамилии с удвоенной согласной в основе почти всегда указывают на иноязычное влияние или на особый путь словообразования. В данном случае перед нами не просто вариант фамилии Иванов, а скорее всего, более поздняя запись фамилии, возникшая под воздействием украинского или белорусского произношения, где имя Иван звучит как Іван, а отчества и фамилии образуются с ударением на второй слог: Іва́ннів.

Суффикс -ов здесь стандартный, патронимический, указывающий на принадлежность потомку человека по имени Иван. Но двойное «н» в корне «Иванн» — это результат аканья и передачи на письме живого произношения. В украинском языке отчество от имени Іван звучит как Іва́ннович, и фамилия Іва́ннів пишется с двумя «н». При переходе в русскую письменную традицию фамилию могли записать как Иванниов, сохранив двойную согласную, но изменив окончание на русское -ов вместо украинского -ів.

Таким образом, носитель фамилии Иванниов с высокой вероятностью происходит из западнорусских земель — современной Украины, Беларуси или юго-западных областей России (Брянщина, Смоленщина), где исторически бытовало такое произношение. Предки — обычные крестьяне или мещане, получившие фамилию по имени отца или деда. В отличие от массовой фамилии Иванов, которая встречается повсеместно, Иванниов — редкая форма, и её написание может служить маркером конкретного региона или даже отдельной семьи, где закрепилась именно такая орфография.

Встречается также версия, что двойное «н» могло появиться при переписывании фамилии из церковных книг, где имя Иван иногда писали как Иоанн, и от него образовывали форму Иоанниов. Но это менее вероятно, так как в бытовой практике церковная форма редко переходила в фамилию простых людей. Самое правдоподобное объяснение — южнорусское или украинское происхождение с последующей русификацией окончания.