Фамилия Изотенкова — женская форма мужской фамилии Изотенков, а та, в свою очередь, образована от имени Изот. Это одна из народных, разговорных форм церковного имени Зотик (в переводе с греческого — «животворящий»). В русском языке имя не прижилось в полной форме, зато дало множество просторечных вариантов: Изот, Изотик, Зот, Зотик. Фамилия Изотенков — одна из них, но с примечательным суффиксом.

Обычно фамилии на -ов/-ев образуются от полных или уменьшительных имён: Иванов, Петров, Сидоров. Здесь же мы видим суффикс -енков. Такая модель типична для южнорусских и украинских говоров, где -енко означало «маленький, сын» (ср. современные украинские фамилии на -енко). В русском языке этот суффикс часто переоформлялся в -енков, то есть «сын Изотенка» — сына человека по прозвищу или имени Изотенок. Исходная форма Изотенок — это уменьшительно-ласкательное от Изот, вроде «маленький Изот» или «сын Изота». Таким образом, Изотенков — это «внук Изота».

Вероятнее всего, предок носителя этой фамилии был крестьянином или посадским человеком из южных областей России (Курская, Орловская, Воронежская губернии) или из тех мест, куда переселялись украинцы. Фамилии на -енков там особенно часты. Встречается также вариант написания Изотенко — без приращения -в, что указывает на более прямую связь с украинской традицией. Фамилия Изотенкова, стало быть, говорит о родовом имени, которое закрепилось за семьёй не по отцу, а по деду — Изоту, чьё имя в быту звучало как Изотенок.