Фамилия Каанин — редкий случай, где географическое происхождение почти наверняка перевешивает все прочие версии. Носители этой фамилии, скорее всего, имеют финские или карельские корни, а сама фамилия образована от топонима — названия места, где жил предок.

В основе лежит финское слово «kaa» или «kaa-» — корень, связанный с понятием «коса» (песчаная коса, отмель) или «узкий пролив». В карельских и финских говорах «kaani» могло означать «кривой», «изогнутый», что также привязано к изгибу реки или берега. Отсюда и названия деревень: например, в Финляндии есть поселение Каанинен (Kaaninen). Фамилия Каанин — это усеченный вариант от более распространенной фамилии Каанинен, где суффикс -ин выступает как русская адаптация финского -nen. В XIX — начале XX века многие финны и ингерманландцы переселялись в центральную Россию и Сибирь, и их фамилии русифицировались, теряя типичное окончание.

Модель образования проста: корень «Каан-» + патронимический суффикс -ин. В русской традиции суффикс -ин означает принадлежность: «чей?» — Каанин, то есть «сын Каано» или «человек из рода Каано». Однако финское имя Каано (Kaanо) тоже существует, хоть и редкое. Оно могло быть уменьшительной формой от имени Каарло (финский вариант Карла). В этом случае версия о происхождении от личного имени тоже имеет право на жизнь, хотя топонимическая — убедительнее: деревень с корнем «Каан» больше, чем людей с таким именем.

Спорных версий здесь немного, и они несерьезны. Например, попытка связать фамилию с тюркским словом «кан» (кровь) или русским диалектным «каать» (пачкать, марать) — лингвистически несостоятельна, так как сочетание «аа» в русских корнях нетипично и почти всегда указывает на заимствование.

В России фамилия Каанин встречается крайне редко, в основном в Карелии, Ленинградской области и среди потомков переселенцев в Сибири. Сословной привязки нет — финские крестьяне и мещане не имели дворянских фамилий, поэтому предки Кааниных были, скорее всего, свободными земледельцами или рыбаками с берегов Ладоги или Финского залива.