Фамилия Кабидуллина — женская форма, а её мужской вариант, Кабидуллин, образован по тюрко-персидской модели. Основа фамилии восходит к мусульманскому составному имени Кабидулла (или Кабидуллах), которое переводится с арабского как «могущество Бога» или «сила Аллаха». Первая часть, «кабид», означает «схвативший», «обладающий силой», вторая — «улла» (Аллах). Имя это — один из эпитетов, подчёркивающих величие Всевышнего, и входило в круг традиционных имён у татар, башкир и других тюркских народов, исповедующих ислам.

В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев, суффикс -ин здесь не указывает на принадлежность «сыну такого-то» в славянском смысле. В тюркской ономастике суффикс -ин (или -ын) мог выполнять роль притяжательного аффикса, но в русской записи он закрепился по аналогии с патронимами вроде «Ильин» или «Никитин». То есть фамилия Кабидуллин — результат адаптации арабо-тюркского имени к русской грамматике при оформлении документов, скорее всего, во второй половине XIX века, когда у мусульманского населения начали массово фиксировать фамилии.

Географически фамилия тяготеет к регионам Поволжья и Урала — Татарстану, Башкортостану, Оренбургской области. Встречается и у казахов, но реже. Предки носителей фамилии, вероятнее всего, были муллами, торговцами или крестьянами, получившими фамилию по имени отца или деда. Интересно, что в старых метрических книгах можно встретить вариации написания — Кабидула, Кабидуллов, что указывает на неустойчивость записи звуков в русской транскрипции.

Спорных версий у этой фамилии почти нет: корень прозрачен, а тюркская основа с религиозным значением не даёт повода для альтернативных толкований. Единственное, что может сбить с толку, — это возможная путаница с фамилией Кабидулин (без двойного «л»). Двойная «л» в суффиксе — результат влияния арабского написания (удвоение согласной в имени Аллах) или просто ошибка писаря, которая со временем закрепилась.