Фамилия Качанюк образована по распространённой восточнославянской модели: к основе прозвища или имени добавили уменьшительный суффикс -юк, характерный для украинской, белорусской и южнорусской ономастики. Суффикс -юк (как и -енко, -ук) часто указывал на «младшего»: сына, ученика или человека, связанного с тем, что названо в основе. В данном случае Качанюк — это буквально «маленький Качан» или «сын Качана».

Основа фамилии — прозвище Качан. В русских говорах «качан» (или «кочан») — это прежде всего плотный вилок капусты. Первая и самая прямая версия: прозвище могли дать огороднику или торговцу капустой, для которого этот овощ был главным в деле. Однако народная фантазия не ограничивалась ремеслом. По внешнему сходству Качаном называли человека полного, коренастого, с круглой головой или плотной фигурой — тут срабатывает та же метафора «свитые в ком листья».

Есть и менее очевидный, но документально зафиксированный вариант. В вятских говорах слово «качан» означало «петух». Прозвище в этом случае могло достаться задиристому, драчливому человеку или, наоборот, местному щёголю, который любил покрасоваться, как петух. Такое расхождение значений не редкость: в народной речи одно и то же слово могло обозначать и предмет, и живого персонажа по сходству поведения или облика.

Фамилия Качанюк не относится к дворянским или княжеским — это типичная фамилия крестьянского или мещанского сословия. Прозвище Качан, со временем закрепившееся за родом, полностью вытеснило исходное крестильное имя и перешло в документы. Сейчас носители фамилии встречаются в основном в западных и южных регионах бывшей Российской империи — там, где суффикс -юк был привычной нормой.