Фамилия Качапина — это, скорее всего, женская форма фамилии Качапин, образованная через суффикс -ин. Однако её основа нестандартна для русской антропонимии: она явно не от канонического имени и не от ремесла, а от прозвища, которое могло звучать как Качапа или Качап.

Главная сложность и интерес в том, что слово «качап» (или «кацап») — это давнее пренебрежительное прозвище русских, которое бытовало в украинской, польской и белорусской среде. Если фамилия восходит к этому корню, то предок носителя мог получить такое прозвище в западнорусских или малороссийских землях. В XVII–XVIII веках, при активных миграциях и переселениях на южные окраины государства, прозвище «Качап» могли дать выходцу из великорусских областей среди местного украинского населения. Фамилия закрепилась бы за его потомками без негативного оттенка — как нейтральный указатель на происхождение.

Версия с диалектным глаголом «качать» (например, «качапа» — тот, кто качает, шатается) менее вероятна, так как суффикс -ап в русских прозвищах почти не встречается, а в украинском языке он более продуктивен. Это подтверждает, что географически фамилия Качапины могла сформироваться на территории современной Украины, Беларуси или юга России, в зоне активного языкового контакта.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Качапин — сын Качапы. Фамилия редкая, в списках массовых русских фамилий она не встречается, что говорит о её локальном происхождении. Носительницы с окончанием -а могли сохранить исходную форму без изменений, если фамилия не склонялась по мужскому роду, но в стандартной русской традиции Качапина — это именно «жена или дочь Качапина».