Фамилия Качура чаще всего имеет прозвищное происхождение, но её смысл зависит от того, в какой местности искать корни. В вологодских говорах «качура» означала горсть хлеба или овса — прозвище могли дать крестьянину, занятому обмолотом или раздачей зерна. В тверских говорах слово имело другое значение: «верзила, дылда». Если основатель рода получил такое прозвище, он был очень высоким человеком.

Есть и третья, менее очевидная версия. Она связывает фамилию с диалектным глаголом «качурать» — «гнуть, коробить, мять, корчить, сводить». В таком случае прозвище могло указывать на вспыльчивый, горячий нрав человека, который «корчится» от гнева или же сам «коробит» окружающих своим поведением. Эта версия правдоподобна, но уступает предыдущим по распространённости: глагольная основа в фамилиях встречается реже, чем прямая характеристика внешности или занятия.

Наконец, не исключена связь с названиями птиц. В белорусском языке «качур» — это селезень, а в русских говорах «качура» могла означать утку-качку. Давая ребёнку такое имя, родители могли верить, что природа примет его как своего и передаст ему качества этой птицы: ловкость, способность держаться на воде или хозяйственную сметку. Однако эта версия менее надёжна: в основе фамилий чаще лежат бытовые прозвища, а не охранительные имена.

Суффикс -а в фамилии Качура типичен для украинских, белорусских и южнорусских прозвищных фамилий, образованных без дополнительных патронимических суффиксов. Это значит, что родоначальника звали просто Качурой, и это прозвище закрепилось за его потомками в неизменном виде. Встречаются и однокоренные фамилии — Качурин, Качуров, Качуровский, но Качура стоит особняком: она сохранила исходную форму, без прибавления -ов или -ин. Такая модель чаще встречается на западе и юге России, а также в Беларуси, что подтверждает и географическая привязка диалектных значений.