Фамилия Кафарлы звучит непривычно для русского уха, и это главная подсказка: её корни не в славянских языках, а в тюркских. Основа фамилии — слово «кафар» или «гафар», которое восходит к арабскому «гафур» (прощающий, всепрощающий) — одному из имён Аллаха в исламе. В тюркской среде это имя нередко давали мальчикам, и со временем от него образовались фамилии. Суффикс «-лы» в азербайджанском и некоторых других тюркских языках выполняет роль, схожую с русским «-ский» или «-ов»: он указывает на принадлежность к роду или месту. То есть Кафарлы — это буквально «из рода Кафара» или «относящийся к Кафару».

Скорее всего, фамилия сформировалась на территории современного Азербайджана или в среде кавказских тюрков. В русском языке она закрепилась в неизменной форме, без типичных славянских суффиксов, что сразу выдает её нерусское происхождение. Встречается она относительно редко, и это не случайно: такие фамилии не прошли массовую «русификацию» через добавление окончаний, как это было, например, с армянскими или татарскими фамилиями в XIX веке.

Интересно, что написание через «а» в первом слоге (Кафарлы) не единственное: в тюркских языках возможен вариант «Гафарлы» с начальным «г», который ближе к арабскому оригиналу. Разница в написании — следствие того, как звук передавали при записи в паспортах или метриках: в русском языке твёрдый «г» на слух мог заменяться на «к». Поэтому носители фамилии Кафарлы и Гафарлы — по сути, однофамильцы, разошедшиеся в орфографии из-за особенностей делопроизводства.

Род занятий предков по этой фамилии напрямую не угадывается — она не указывает на ремесло или место жительства, а только на личное имя родоначальника. Можно лишь предположить, что носители фамилии были мусульманами и жили в регионах, где арабские имена через тюркскую культуру становились основой для фамилий. В целом, Кафарлы — пример того, как фамилия сохраняет память о религиозном имени, которое в повседневной речи превратилось в родовое прозвище.