Фамилия Какошин — редкий случай, когда основа, скорее всего, не прозвище и не профессия, а местное диалектное слово. Разбирать её привычным способом (от имени или занятия) было бы ошибкой: корень «какош» в русских говорах имел вполне конкретное, хоть и неожиданное значение.

В словарях народных говоров зафиксировано слово «какоша» — так в некоторых областях (вятские, пермские говоры) называли курицу-наседку или просто квохчущую птицу. Слово звукоподражательное, от «ко-ко» и «квохтать». Фамилию Какошин могли дать по отцу, которого в деревне прозвали Какоша. Почему? Причин могло быть несколько: либо человек держал много кур и торговал яйцами, либо его сравнивали с квохчущей птицей за манеру говорить (бормотать, ворчать себе под нос), либо за суетливый, хлопотливый характер. В ономастике такие «птичьи» фамилии встречаются, но обычно от названий диких птиц (Соколов, Воробьёв), а «домашняя» куриная тема — редкость.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей сын?» — Какошин, то есть сын Какоши. Это типичная модель для прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (как Пушкин от Пушка, Гагарин от Гагара). Спорных версий здесь немного. Можно предположить связь с тюркским «как» (твердый, сухой) или с глаголом «какать» (пачкать), но эти гипотезы слабые: они не объясняют суффикс «-ош-» и не имеют бытового подтверждения в русской среде. Версия с курицей-наседкой и доказана диалектными записями, и логична для крестьянского быта.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку России — Вятка, Пермь, отчасти Кострома. В центральных и южных регионах она почти не встречается. Социально это однозначно крестьянская фамилия: в среде духовенства или дворянства такие прозвища не приживались. Известных носителей, оставивших след в истории, нет — фамилия осталась в своей среде, не вышла за пределы деревенского уклада.