Фамилия Каковин — одна из тех, где за привычным окончанием скрывается неочевидная основа. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Каковин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Какова. Само прозвище, скорее всего, связано с глаголом «коковать» — кричать кукушкой, предсказывать зловещее. В народе кукушку не жаловали: её голос считался вестником беды, а человека, похожего на неё голосом или мрачным нравом, могли дразнить Коковой или Каковой. Чередование а/о в корне (Какова вместо Кокова) — следствие местных говоров: в одних селениях окали, в других акали, и прозвище записывали на слух.

Но есть и вторая версия, которую не стоит сбрасывать со счетов. Глагол «коковать» в некоторых диалектах означал не только кукование, но и работу со льном или пенькой — трепать, мять, чесать волокно. В этом случае прозвище Какова могло закрепиться за прядильщиком или ткачом. А ещё «коковка» в старину называлась резная деталь на крыше избы, нечто вроде конька. Тогда Какова — человек, который украшал дома деревянной резьбой. Три разных занятия, три возможных предка, но всех объединяет одно: прозвище было не случайным, а профессиональным или характерным.

Модель образования фамилии типична для северных и центральных русских земель, где суффикс -ин присоединяли к основам на -а (Какова → Каковин). В южных и западных регионах от того же прозвища скорее возникла бы фамилия Каковенко или Каковский. Поэтому география фамилии Каковин — преимущественно Поволжье, Вятка, Архангельская область.

В итоге фамилия рассказывает о предке, которого в округе знали по голосу, по ремеслу или по примете. Какая из версий верна для вашей семьи — без генеалогического поиска не угадать. Но в любом случае прозвище Какова было достаточно ярким, чтобы пережить века и закрепиться в фамилии.