Фамилия Калдырова — женская форма от мужской фамилии Калдыров. Её основа, скорее всего, тюркская, и географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили тюркоязычные народы: татары, башкиры, казахи, ногайцы. Встречается она и на Северном Кавказе, в частности у кумыков и ногайцев, что указывает на общий корень.

Ключ к значению фамилии — слово «калдыр» или «калды». В тюркских языках «калды» означает «остался». Соответственно, «калдыр» может быть формой повелительного наклонения («оставь») или частью сложного имени. Самая распространённая версия: фамилия образована от прозвища Калдыр, которое давали младшему, позднему или последнему ребёнку в семье — тому, кто «остался» после всех, как бы завершил череду детей. В тюркской антропонимии такие имена-обереги были обычным делом: считалось, что называя ребёнка «остатком», родители обманывают злых духов и сохраняют ему жизнь.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с профессией или ремеслом. В некоторых диалектах «калдыр» могло означать человека, занимающегося плавкой металла или оставлением окалины (кал — окалина, остаток). Однако эта гипотеза не находит серьёзной поддержки в ономастических словарях и уступает «детской» версии по частоте упоминаний.

Модель образования фамилии стандартна для русского языка: к тюркской основе Калдыр добавлен русский патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Калдыров). В женском роде он закономерно меняется на -а. Интересно, что в самой тюркской среде фамилия могла бы звучать как Калдырулы (у казахов) или Калдыров (у татар уже как русифицированный вариант). Встречаются также близкие по звучанию фамилии Калдаров, Калдыбаев, Калдыгулов, но их корни могут различаться: например, Калдаров может быть образован от имени Калдар (кал + дар — «имеющий силу»), что совсем другая история.

Сословно фамилия не элитарна: её носителями были в основном крестьяне, казаки, мастеровые. В дореволюционных метрических книгах Оренбургской, Уфимской и Астраханской губерний Калдыровы встречаются как государственные крестьяне и тептяри. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано.