Фамилия Калерина — редкий пример, когда суффикс -ин указывает не на принадлежность отцу, а на женскую форму фамилии. В русской ономастике фамилии на -ин обычно образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я: Пушкин (от Пушка), Ильин (от Илья). Калерина же имеет основу, оканчивающуюся на согласный, что для мужского варианта дало бы окончание -ов (Калеринов). Поэтому перед нами, скорее всего, женская фамилия, которая закрепилась за женщиной и не изменилась при передаче по наследству, либо это фамилия, образованная от женского имени или прозвища.

Корень фамилии — «Калера». Это слово имеет два возможных источника. Первый — итальянское «calera» (карета, повозка) или «calesse» (коляска). В южнорусских и малороссийских говорах «калера» означала «повозка», «тарантас»; так могли прозвать возчика, извозчика или мастера, делавшего экипажи. Второй вариант — от диалектного «калера» в значении «холера» (искажённое произношение). В народе холеру нередко называли «калерой», и такое прозвище могли дать человеку, пережившему эпидемию, либо родившемуся в холерный год, либо слишком худому и бледному.

География фамилии узкая. Калерины встречаются в основном в южных областях России (Краснодарский край, Ростовская область) и на Украине. Это косвенно подтверждает версию о южнорусском или украинском происхождении корня. В центральных и северных губерниях фамилия практически не фиксируется.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Калерин, Калеринов, Калера — показывает, что форма Калерина осталась неизменной, что говорит о её относительно позднем закреплении в документах (конец XIX — начало XX века). В метрических книгах того времени женские фамилии часто записывались без изменения окончания, особенно если женщина была главой семьи или вдовой.

Таким образом, наиболее вероятное значение фамилии Калерина — «дочь или жена извозчика» (от прозвища Калера — возчик). Менее вероятная, но возможная версия — связь с холерой. Обе гипотезы укладываются в народную, бытовую традицию образования русских фамилий.