Фамилия Каликенов звучит непривычно, и это сразу наводит на мысль о нерусской основе. Действительно, перед нами одна из тех фамилий, которую принесли в Россию тюркские народы, и её разбор заставляет обратиться к восточным языкам.

Самый вероятный источник фамилии — мужское имя Каликен. Это сложносоставное имя, распространённое у казахов, башкир, татар и других тюркоязычных народов. Первая часть, «кали» (или «гали»), восходит к арабскому «али» — «высокий», «великий», «возвышенный». Вторая часть, «кен», в тюркских языках означает «широкий», «просторный», а в переносном смысле — «широкая душа», «щедрый». Таким образом, имя Каликен можно перевести как «великий и щедрый» или «высокий и широкий». Фамилия образовалась по русской модели: к основе имени добавили типичный русский патронимический суффикс -ов, означающий «сын» или «потомок». То есть Каликенов — это «сын Каликена».

Встречается и другая, менее правдоподобная версия. В русском языке есть слово «калика» (или «калека»), которое в древности означало странника, нищего, паломника, а позже — человека с увечьем. Однако фамилии от этого слова обычно имеют форму Каликин, Каличкин или Каличенков. Форма Каликенов с суффиксом -енов для русского прозвища нехарактерна. Поэтому тюркское происхождение выглядит гораздо убедительнее.

Фамилия Каликенов редкая и имеет чёткую географическую привязку. Чаще всего она встречается в Оренбургской области, Башкортостане, Челябинской области, а также в Казахстане. Это зона расселения башкир и казахов, где подобные имена были в ходу. Предки современных Каликеновых, скорее всего, были мусульманами и носили имя Каликен, которое при проведении переписей или при получении паспортов в XIX–XX веках было записано как фамилия.

Интересно, что фамилия сохранила оригинальное ударение на второй слог — Кали́кенов, что тоже указывает на её восточный корень. В русских фамилиях ударение чаще падает на суффикс, но здесь оно осталось на имени-основе. Эта особенность отличает Каликеновых от похожих по звучанию, но других по происхождению фамилий, например, от Калинкиных или Калининых.