Фамилия Калишин — одна из тех, где на первый взгляд всё ясно, а приглядишься — и начинаются варианты. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Калишин — это «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу или имени Калиша. Но вот что скрывается за основой «Калиш-»?

Самая прямая версия — от уменьшительной формы крестильного имени Каллистрат (в просторечии Калистрат). Имя греческое, означает «прекрасновоин», но в русских деревнях его перекроили на свой лад: Калистрат, а в быту — Калиша. Если так, то фамилия Калишин — ровесница многих «домашних» фамилий на -ин, образованных от обиходных форм канонических имён.

Вторая версия — отчество от прозвища Калиша, которое, в свою очередь, могло быть связано с диалектным словом «калика» (калека, странник, нищий). В старину «каликами перехожими» называли паломников и бродячих певцов, и прозвище Калиша могло закрепиться за человеком, который ходил по миру или имел физический недостаток. Суффикс -ш- в прозвищах встречается, хоть и реже, чем -к- или -х-.

Интересна и региональная привязка. Фамилия Калишин встречается в основном в центральных областях России, особенно в Тверской и Московской губерниях. Это наводит на мысль, что основа могла быть связана с местным говором. Например, в тверских говорах «калиш» — это нечто вроде кислого или прокисшего напитка, но это значение слишком узкое, чтобы стать основой для фамилии.

Спорным остаётся вопрос: могла ли фамилия произойти от названия рыбы «каляка» (белуга) или от слова «калиться» (закаляться)? Такие версии существуют, но они слабые. Ни в одном серьёзном ономастическом словаре (ни у Унбегауна, ни у Веселовского) нет подтверждения, что «калиш» было распространённым прозвищем для рыбака или кузнеца. Поэтому наиболее правдоподобным остаётся имя Калистрат в его краткой форме.

Таким образом, Калишин — скорее всего, потомок Калиши, то есть Каллистрата. Фамилия не редкая, но и не массовая, что говорит о локальном распространении исходного прозвища.