Фамилия Каллабухов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с тюркским языком. В ней отчётливо слышится основа «каллабух» или «калабух», которую исследователи связывают с тюркским словом «калаба» (суматоха, шум, беспорядок) или «калабулык» (суета, тревога). Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, отличался беспокойным, суетливым нравом, был непоседой или зачинщиком переполоха. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным русским словом «калабух» — так в некоторых говорах называли небольшой хлебец, колобок, но тюркская версия выглядит убедительнее, учитывая ареал бытования фамилии.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель образования: от прозвища Каллабух путём прибавления патронимического суффикса, означающего «сын» или «принадлежащий». То есть Каллабухов — буквально «сын Каллабуха». Форма с двойным «л» (Каллабухов, а не Калабухов) — это, вероятно, результат позднейшего закрепления на письме: в устной речи двойная согласная могла возникнуть под влиянием написания или как диалектная особенность произношения.

Фамилия явно недворянская и не княжеская. Её носители — выходцы из крестьянской или мещанской среды, скорее всего, из южнорусских или поволжских регионов, где исторически было сильное тюркское влияние (территории бывшего Казанского ханства, Астраханской губернии, Донского казачества). Встречается она редко, и это дополнительный ключ: если фамилия не распространена массово, её основа чаще сохраняет прямую связь с прозвищем, а не с крестильным именем.

Похожая по звучанию фамилия Калабухов (с одной «л») встречается чаще, и её нередко путают с Каллабуховым, но в написании с двумя «л» прослеживается более отчётливая тюркская огласовка. В словарях русских фамилий эта форма почти не зафиксирована, что делает её особенно интересной для локальной семейной истории: скорее всего, все современные Каллабуховы — потомки одного человека, прозванного так за характер или поведение.