Фамилия Калмынин — один из тех случаев, где корень говорит сам за себя, но не всё так прямолинейно. В её основе лежит слово «калмык» — название народа. Однако носитель фамилии совсем не обязательно был калмыком по крови. В русской традиции XVII–XIX веков «калмыками» нередко называли любого человека с раскосыми глазами, смуглой кожей или просто того, кто носил длинные волосы и окладистую бороду — внешность, которая ассоциировалась с этим степным народом. Так могли прозвать и русского крестьянина, и купца, и служилого человека, если он хоть отдалённо напоминал калмыка.

Модель образования типична для восточнорусских и сибирских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Калмынин — буквально «сын Калмыка» или «человек из рода Калмыка». В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от полных форм имён, -ин характерен для прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. «Калмыка» — акающая форма, которая и закрепилась в основе.

Интересная деталь: в переписных книгах XVII века по Поволжью и Приуралью фамилия Калмынин встречается не только у русских, но и у крещёных татар, чувашей и мордвы. Там прозвище «Калмык» могло означать «чужак», «пришлый» или «кочевник» — то есть человека, переселившегося из степи в оседлую деревню. Таким образом, фамилия могла закрепиться за разными этническими группами, и её носители сегодня — потомки самых разных людей, объединённых лишь внешним сходством или бытовой кличкой.

В XIX веке Калмынины чаще всего числились государственными крестьянами в Симбирской, Самарской и Оренбургской губерниях. Встречались и в казачьих станицах на Урале — там прозвище могло отражать службу в степных гарнизонах, где контакт с калмыками был делом обычным. Дворянских родов с этой фамилией история не знает, что подтверждает её «низовое» происхождение — из крестьянской или мещанской среды.

Есть и альтернативная версия, менее вероятная: связь с тюркским словом «калмын» — «оставаться», «оставленный». Но она не подкреплена ни географией бытования фамилии, ни документами переписей. Основной и очевидный корень — народное прозвище, и это тот случай, когда фамилия прямее всего говорит о том, как предка видели окружающие.