Фамилия Калниболотчук — редкий случай, когда географическое прозвище «срослось» с украинским патронимическим суффиксом. Её основа — «Калниболото», название села (или хутора) в центральной Украине. Такие топонимические фамилии давали переселенцам: «Калниболотчук» буквально значит «потомок того, кто из Калниболота».

Разбираем слово «Калниболото»: первая часть — «калный» (от «кал», то есть грязь, топь, нечистоты), вторая — «болото». В сумме получаем «грязное болото», «топкое место». Это не оскорбление, а типичный для украинской топонимики описательный ойконим — таких названий (Гнилопять, Кривая Балка) много в центральных и южных областях. Село с похожим именем действительно существует: Калниболота (иногда Калниболото) есть в Кировоградской области, но возможны и другие одноимённые поселения.

Суффикс «-чук» — классический украинский патроним (сын, потомок). Он присоединяется к основе напрямую, без дополнительных суффиксов, что указывает на довольно позднее образование фамилии (XVII–XIX века), когда модель «прозвище + -чук» стала массовой у казаков и крестьян Правобережья. Если бы фамилия возникла раньше, мы бы увидели форму «Калниболотенко» или «Калниболотский».

Интересная деталь: фамилия почти не встречается в России и Беларуси. Её ареал — центральная Украина и, возможно, юг Молдовы (куда переселялись украинские крестьяне). Носители Калниболотчук — почти наверняка потомки казаков или вольных хлеборобов, а не крепостных: в крепостной Украине фамилии на «-чук» были редкостью, их чаще фиксировали у свободного населения.

Версия о связи с прозвищем «Калниболот» (человек, пачкающийся в грязи или живущий у болота) менее правдоподобна: тогда фамилия была бы Калниболотченко или Калниболотов, а не с топонимическим суффиксом «-чук». Скорее всего, предок просто был родом из села, которое называли «грязным болотом».