Фамилия Калпашникова — это женская форма от фамилии Калпашников. В её основе лежит прозвище Калпашник, которое, в свою очередь, образовано от слова «калпак» (или «колпак»). Это слово пришло в русский язык из татарского. Калпаком называли высокую шапку, сужающуюся кверху, с узким меховым отворотом. Такие шапки шили из дорогих тканей — бархата, парчи, украшали жемчугом и драгоценными камнями. В древности их носили московские князья и государи. Кроме того, калпаком именовали воинский шлем: он состоял из венца, увенчанного металлическим навершием (репьём или яблочком), а к нему иногда крепили кольчужную сетку для защиты щёк, затылка и плеч. Сетку застёгивали у шеи или на груди запонками.

Исходя из этого, прозвище Калпашник могло указывать на разные занятия или качества человека. Возможно, предок был знатного происхождения, носил такой головной убор. Или же он был воином — храбрым, носящим шлем-калпак. Третья версия: он был ремесленником — мастером, который изготавливал калпаки и колпаки. В некоторых культурах, например в киргизской, калпак — священный национальный символ, связывающий человека с историей предков. Прозвище Калпашник закрепилось за человеком, а затем, по обычаю, перешло в фамилию Калпашников. Её женская форма — Калпашникова — указывает на то, что носительница является потомком того самого Калпашника.