Фамилия Капашникова — женская форма мужской фамилии Капашников. Её основа — прозвище или профессиональное именование Капашник. Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «капаш» — так в некоторых русских говорах называли капюшон, башлык или головной убор, закрывающий лицо от непогоды. Соответственно, Капашником могли прозвать либо портного, шившего такие капюшоны, либо человека, который постоянно носил подобный головной убор — по характерной детали внешности. Слово «капаш» в этом значении родственно общеславянскому «капа» (шапка, колпак) и зафиксировано в северных и сибирских говорах, что даёт намёк на возможную географию фамилии.

Менее распространённая, но допустимая версия — связь с тюркским корнем «кап» (мешок, сосуд, футляр). В этом случае Капашник мог быть мастером по изготовлению кожаных мешков, сумок или перемётных сум. Однако против этой версии говорит русский суффикс -ник, который чаще присоединяется к исконно славянским основам и обозначает человека по роду занятий или характерному предмету.

Фамилия образована по продуктивной модели: прозвище на -ник → фамилия на -ов. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Капашника». Встречаемость фамилии невысокая, что характерно для прозвищ, связанных с конкретными ремёслами или бытовыми деталями, не получившими массового распространения. В документах XIX века Капашниковы фиксируются преимущественно в центральных и поволжских губерниях, что согласуется с ареалом слова «капаш» в значении «капюшон». Сословная принадлежность у носителей фамилии была разной: встречаются и крестьяне, и мещане, и купцы — прозвище не было строго привязано к одному социальному слою.