Фамилия Калуженина — женская форма фамилии Калуженин. В русской ономастике это сравнительно редкий случай, когда фамилия образована не от отчества или прозвища отца, а напрямую от названия жителя определённой местности. Суффикс -енин (в современном произношении часто редуцируется до -енин) указывает на принадлежность к группе людей, связанных с конкретным топонимом. По той же модели возникли фамилии Москвитин, Тверитин, Пермитин.

В основе лежит слово «калуженин» — житель города Калуги или Калужской земли. В древнерусском языке и диалектах форма «калужанин» постепенно вытеснялась вариантом «калуженин» под влиянием северо-восточных говоров, где суффикс -енин был продуктивен. Таким образом, первый носитель фамилии Калуженин, скорее всего, был выходцем из Калуги или её окрестностей, который поселился в другом регионе. За ним закрепилось прозвище по месту прежнего жительства, которое затем перешло в фамилию.

Сам топоним «Калуга» имеет несколько версий происхождения. Наиболее убедительная связывает его с древнерусским словом «калуга» — топь, болото, трясина. В говорах это слово фиксируется в значении «грязь, жидкая грязь на дороге». Город стоит на Оке, в низинной местности, что делает эту этимологию логичной. Менее вероятна версия от тюркского «калыга» (остаток, запас), хотя её иногда приводят в краеведческой литературе.

Фамилия Калуженина не относится к числу широко распространённых. Встречается преимущественно в центральной России и Поволжье, что косвенно подтверждает миграционный характер: переселенцы из Калужской губернии в XVII–XIX веках активно осваивали земли Среднего и Нижнего Поволжья. В документах XVIII века можно найти упоминания калужских крестьян, переселившихся в Саратовскую и Самарскую губернии, — именно в этих местах фамилия фиксируется чаще всего.

Интересно, что фамилия Калуженин (и её женская форма) не претерпела типичной для многих топонимических фамилий замены суффикса. Если бы она образовалась стандартно, по модели «Калужский», мы бы имели фамилию Калужский/Калужская. Но сохранение архаичного суффикса -енин указывает на то, что фамилия сложилась в народной среде, скорее всего, среди крестьян или посадских людей, а не в дворянской среде, где предпочитали формы на -ский.