Фамилия Калынюк — яркий пример украинской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -юк. Этот суффикс в украинской ономастике выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев или -ин: он указывает на принадлежность, родство, чаще всего — на сына человека, чьё имя или прозвище легло в основу. Поэтому Калынюк — это буквально «Калынов сын» или «потомок Калына».

Основа фамилии — имя Калін (Калин). Это не календарное церковное имя, а народная, разговорная форма нескольких имён: чаще всего — Каллистрат (греч. «прекрасновоин»), реже — Калинник (греч. «добрый победитель») или Иакинф (от греч. гиацинт). В украинской и белорусской среде такие сокращения были обычны: длинное и редкое в быту имя ужималось до двух-трёх слогов, а затем обрастало фамильным суффиксом.

Суффикс -юк характерен для западных и центральных областей Украины (Волынь, Подолье, Галичина), а также для прилегающих территорий Беларуси и юга России, куда шли миграционные потоки. Соответственно, предки Калынюков с высокой вероятностью происходили из этих регионов — из крестьян или казаков, где фамилии на -юк были массовыми.

Встречается и версия, связывающая основу с растением калина. Но она менее убедительна: прозвища по деревьям в украинской среде давали, но они обычно оформлялись иначе — Калинка, Калиновский, Калиненко. А вот от имени через патронимический суффикс — это стандартный и частотный путь. Поэтому Калынюк — это «чей-то сын», и «Калын» — это человек, носивший имя Калин.

С точки зрения орфографии стоит обратить внимание на букву «ы» в корне. В украинском языке на месте русского «и» часто пишется «и» (Калін), но в русской записи фамилии закрепилась форма через «ы» — Калынюк. Это отражает реальное произношение в некоторых говорах (близкое к «калын»), либо просто адаптацию при записи паспортных данных. Вариант с «и» (Калинюк) тоже существует, но менее распространён.

Социальный состав носителей фамилии — преимущественно крестьянство, реже казачество. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано: суффикс -юк указывает на простолюдина, а не на шляхтича, который чаще брал фамилию на -ский. Так что Калынюки — это потомки тех, кто пахал землю или нёс службу на пограничье Речи Посполитой и Запорожской Сечи.