Фамилия Калышев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Калышев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Калышев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Скорее всего, фамилия Калышев происходит от тюркского имени Калыш. Вероятно, в его основе лежит слово «калы» - «родинка». Следовательно, Калышем могли назвать мальчика с родинкой. Однако возможно, что имя Калыш происходит от татарского глагола «калышу» - «уступать, отставать, отстать». Согласно другой гипотезе, фамилия Калышев образована от прозвища, которое указывало на место жительства человека. Калиш — город в Великопольском воеводстве Польши. Он является самым старым городом в Польше. Во II веке н. греческий географ Клавдий Птолемей в своем «Географическом обзоре» прямо упомянул город Кализию, и этот город отождествляется с современным Калишем. Он также является центром гмины Калиш и городом на правах повята (городской повят). Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Калышев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Калышев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.