Фамилия Каменер — редкий случай, когда профессиональное прозвище застыло в почти неизменной форме, без типичных русских суффиксов -ов или -ин. В ней слышна немецкая или еврейская (ашкеназская) модель: основа «камен» + суффикс деятеля -ер. Человек с такой фамилией — не «сын Каменя», а сам «каменщик», «камнетёс» или «тот, кто работает с камнем». В немецком языке слово Steinmetz («каменщик») передаёт то же значение, но в фамилии Каменер корень остался славянским, а окончание — германским.

Скорее всего, фамилия сложилась на территории черты оседлости (современные Украина, Беларусь, юго-западные губернии Российской империи), где в XIX веке при массовой фиксации фамилий еврейскому населению нередко давали «говорящие» прозвища по роду занятий. Каменер — прямой аналог фамилий Шнайдер (портной), Фишер (рыбак) или Циммерман (плотник), но с местной, славянской основой. Это указывает на то, что предок носителя фамилии действительно был каменщиком или резчиком по камню — ремесленником, а не владельцем каменоломни.

Встречается и более редкая, дворянская версия происхождения — от топонима Каменер (Kamenër) в Албании или Каменер (Kamenár) в Словакии. Но для русскоязычной среды эта версия маловероятна: фамилия почти не фиксируется в старых дворянских родословных книгах и не даёт географического следа в Центральной России. Основной ареал бытования — западные регионы бывшей империи и крупные города, куда в конце XIX — начале XX века мигрировали ремесленники.

Интересно, что фамилия избежала русификации: не стала Каменниковым или Каменщиковым. Она осталась «иностранной» по форме, хотя корень — чисто русский. Это делает её своеобразным мостом между языками и культурами: славянское ремесло, названное на немецкий лад.