Фамилия Канбеков образована от тюркского составного имени или прозвища Канбек. Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе Канбек прибавлен русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — «сын Канбека»). Такой способ формирования фамилий характерен для народов Поволжья, Урала и Сибири, где в XIX — начале XX века тюркские имена адаптировались под русскую фамильную систему.

Само имя Канбек — сложное. В нём соединились два элемента разного происхождения. Первая часть, «кан», восходит к монгольскому слову со значением «высокий». Вторая часть, «бек», — тюркский титул, который переводится как «князь, повелитель, господин, начальник». Таким образом, в основе фамилии лежит прозвище, которое можно истолковать как «высокий господин» или «великий князь». Вряд ли оно указывало на реальный титул носителя: скорее, это было почётное именование, которое давали ребёнку с пожеланием стать уважаемым, влиятельным человеком.

С точки зрения географии, фамилия Канбеков чаще всего встречается у татар и башкир, а также у народов Северного Кавказа, где распространены тюркские именные модели с компонентом «бек». Встречаются варианты написания Канбе́ков и Канбеко́в — ударение может падать как на второй, так и на третий слог, что зависит от региональной произносительной традиции.

Интересно, что фамилия Канбеков не имеет однозначного аналога среди славянских фамилий, но по структуре стоит в одном ряду с такими распространёнными тюрко-русскими фамилиями, как Ахметбеков, Бекмуратов или Тугушев. В каждом таком случае суффикс -ов выполняет роль моста между тюркским именем и русской фамильной системой.