Фамилия Кантовская — это женская форма, а её мужской вариант — Кантовский. Такая модель образования (на -ский/-ская) в русской традиции чаще всего указывает на географическое происхождение: родоначальник мог получить фамилию по названию населённого пункта, откуда он был родом или где владел землёй. В данном случае это могла быть местность с корнем «Кант» — например, деревня Кантово, Кантовка или село с похожим именем.

Но есть и вторая, не менее вероятная версия: фамилия могла произойти от прозвища или мирского имени Кант. В западнорусских и украинских говорах «кант» означало не только философское понятие, но и окантовку, кайму, оторочку на одежде. Человека, который шил или продавал такую тесьму, могли прозвать Кантом, а его потомков — Кантовскими. В польской и белорусской ономастике фамилии с суффиксом -ский нередко закреплялись за шляхтой, но со временем распространились и среди крестьян, получивших прозвища по ремеслу.

Третья возможность — связь с именем собственным. В немецкой традиции Кант — это сокращение от Конрад, и фамилия могла прийти в русскую среду через переселенцев или через образование от имени отца. Однако в таком случае ожидалась бы форма Кантов, а не Кантовский, поэтому версия с топонимом или прозвищем выглядит убедительнее.

Географически фамилия Кантовская встречается в основном на западе России, в Беларуси и на Украине. Это хорошо согласуется с ареалом фамилий на -ский, которые особенно характерны для бывших земель Речи Посполитой. Известных носителей с такой фамилией в истории не зафиксировано, что делает её типичным примером локальной родовой фамилии, не получившей широкой известности за пределами своего региона.