Фамилия Канука — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного русского суффикса -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами либо позднее заимствование, либо фамилия, образованная по иной модели. Чаще всего такие фамилии встречаются на юге России, в казачьих областях, или среди народов Северного Кавказа и Закавказья.

Самый вероятный путь образования — от прозвища или имени Канука. В осетинском языке слово «канук» означает «слепой» или «подслеповатый». Прозвище могли дать человеку с плохим зрением. В тюркских языках, например в кумыкском или ногайском, «канук» имеет значение «закрытый», «запертый», что тоже могло стать основой для прозвища — возможно, замкнутого или нелюдимого человека. Есть и версия, что Канука — это форма еврейского имени Ханох (Енох), которая через идиш могла превратиться в фамилию, но для этого нужно подтверждение в виде документов о бытовании в еврейских местечках, а пока таких данных нет.

В пользу южного происхождения говорит и география. Фамилия Канука фиксируется в Краснодарском крае, Ростовской области, а также в Грузии и Абхазии. В XIX веке носители фамилии могли быть крестьянами или казаками, но сословная принадлежность без генеалогического исследования остаётся предположением.

С точки зрения словообразования фамилия стоит особняком: окончание -а типично для украинских, белорусских и польских фамилий (типа Грыца, Сковорода), но в русской среде оно встречается реже. Возможно, Канука — это русифицированная форма более длинной фамилии вроде Кануков, где отсекли суффикс при адаптации. Однокоренные параллели — фамилии Кануков, Канукин — встречаются среди осетин и терских казаков.

Итог: фамилия Канука, скорее всего, имеет кавказские или тюркские корни и связана с прозвищем, характеризующим внешность или характер предка. Точное значение зависит от языка-источника, но в обоих случаях оно не было комплиментом.