Фамилия Каныкин — один из примеров того, как прозвище превратилось в родовое имя. В её основе лежит прозвище Каныка, и у исследователей есть на этот счёт две версии.

Первая отсылает к ремеслу. В русских говорах «канька» — это деревянная кружка или небольшой жбан. Человека, который делал такую посуду, могли прозвать Каныкой, а его дети и внуки со временем стали Каныкиными. Вторая версия связывает прозвище с глаголом «канючить» — беспрестанно просить, надоедать, клянчить. Тогда Каныкой называли назойливого или приставучего человека.

С точки зрения словообразования фамилия относится к самой распространённой модели на -ин. Такие фамилии обычно возникали от основ на -а, -я: Каныка → Каныкин. Суффикс -ин указывал на принадлежность: «чей сын?» — «Каныкин».

Какая из двух версий правдоподобнее? Однозначного ответа нет. Обе возможны, но первая — ремесленная — встречается в фамилиях этого типа чаще: прозвища по профессии были устойчивее и легче закреплялись как фамилии. Впрочем, в пользу «канючного» корня говорит и то, что прозвища по поведению тоже давали охотно, и глагол «канючить» широко распространён в народной речи.

Фамилия Каныкин редкая, не входит в число распространённых русских фамилий. Встречается в центральных областях России, но массовой географии не имеет. Это типичная фамилия крестьянского или ремесленного сословия — в дворянских родословных книгах она не фигурирует. Словари русских фамилий (например, работы Б. Унбегауна или В. Никонова) отдельно её не разбирают, но модель образования и диалектная основа хорошо вписываются в описанные ими закономерности.