Фамилия Капишен — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа и суффикс сразу указывают на то, что перед нами не типичная русская фамилия на -ов/-ев или -ин, а скорее фамилия, пришедшая через украинский или белорусский языковой фильтр, либо оформленная по польской модели.

Ключ к разгадке — суффикс -ен. В русском языке этот суффикс в фамилиях встречается редко, чаще он характерен для украинских и белорусских фамилий, где он означает «чей?», «сын кого?» (например, Гриценко, Тимошенко). Однако в фамилии Капишен окончание -ен может быть как редуцированным вариантом украинского -енко, так и польским уменьшительным суффиксом, который входил в состав прозвищ. В любом случае, это говорит о том, что фамилия формировалась не в центральной Великороссии, а на западнорусских землях или в среде, испытавшей польское влияние.

Самая вероятная основа — слово «капиш» или «капиша». В польском языке «kapiszon» — это пистон (капсюль для ружей), а также колпачок, наконечник. В украинских говорах «капіш» или «капіша» могло означать шапку, капюшон, накидку. Таким образом, прозвище Капиш могли дать человеку, который носил характерный головной убор (например, капюшон, необычную шапку) или, что менее вероятно, занимался изготовлением ружейных пистонов. Фамилия Капишен, следовательно, означает «сын Капиша» или «маленький Капиш».

Менее правдоподобная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским корнем «кап» (мешок, сосуд). В этом случае прозвище Капиш могло относиться к торговцу или человеку, носившему большие мешки. Однако фонетика (суффикс -иш) для тюркского заимствования в этой форме нехарактерна, поэтому версия с головным убором или польским «капсюлем» выглядит убедительнее.

География фамилии сегодня размыта, но её корни, скорее всего, ведут на запад современной Украины, в Беларусь или на юго-восток Польши. В сословном отношении предки Капишенов, вероятнее всего, были крестьянами или мещанами; фамилия не выглядит дворянской или купеческой.

Коротко: фамилия Капишен образована от прозвища Капиш (человек в капюшоне или шапке) с помощью суффикса -ен, типичного для западнорусских земель.