Фамилия Капишева — женская форма фамилии Капишев, которая образована от прозвища или имени Капиш. Основа здесь неочевидна, и у неё есть как минимум две версии происхождения, причём одна заметно правдоподобнее другой.

Первая версия — самая прозрачная: фамилия связана с тюркским словом «капыш» (вариант «капуш»), что в некоторых тюркских языках означает «ворота», «дверь» или «проход». В русских говорах это слово могло закрепиться как прозвище человека, жившего у ворот, сторожа или того, кто занимался торговлей у проезжих ворот. Учитывая, что фамилии с суффиксом -ев (-ов) в Поволжье и на юге России часто имеют тюркские корни, эта версия выглядит обоснованной. Географически фамилия Капишев встречается в Волгоградской, Астраханской областях и в Калмыкии — как раз в зоне активного тюрко-славянского контакта.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: основа от уменьшительной формы канонического имени Капитон (греч. «крепкоголовый»). В народных говорах Капитон мог превратиться в Капиша, Капиш, а затем и в фамилию. Однако такая форма сокращения для имени Капитон нетипична — обычно встречаются Капитонов, Капитошин, а Капишев — редкое исключение. Если бы фамилия была от имени, скорее бы закрепился суффикс -ин (Капишин), а не -ев.

Модель образования — патронимическая: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?» — Капишев, то есть сын Капиша). Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Капи́шева, хотя в разговорной речи возможен вариант с ударением на первый.

Исторически носители фамилии Капишев — это, вероятно, крестьяне или мещане из южнорусских и поволжских губерний, где оседали выходцы из тюркских народов. В дореволюционных источниках фамилия не была широко распространена, что говорит о её локальном характере. Среди известных носителей нет громких исторических фигур, но это типичная фамилия, сохранившая бытовое прозвище предка.