Фамилия Капишев — одна из тех, что напрямую отсылает к языческой древности. В её основе лежит прозвище Капиш, а оно, в свою очередь, восходит к слову «капище». Так называли культовое сооружение у восточных и прибалтийских славян дохристианского периода. Само слово «капище» происходит от старославянского «капь» — «изображение, идол». Одно из древнейших капищ археологи открыли при раскопках на Перыни под Новгородом, а письменные источники, например «Слово о законе и благодати» митрополита Илариона (XI век), подтверждают, что термин был в ходу уже в ту эпоху.

Прозвище Капиш могло закрепиться за человеком по-разному. Самая прямая версия: основатель рода был служителем капища — жрецом или лицом, ответственным за отправление культа. Однако в более поздние, уже христианские времена, такое прозвище могли дать и сильно верующему, набожному человеку, возможно, с оттенком иронии или удивления его рвением. В любом случае, прозвище указывало на сильную связь человека с религиозной сферой, пусть и разного содержания.

Словообразовательная модель проста: к основе «Капиш» добавился типичный русский суффикс принадлежности -ев, образующий фамилии от прозвищ и имён, оканчивающихся на мягкий согласный или шипящий. Суффикс указывает на прямое родство: Капишев буквально означает «сын Капиша», «потомок Капиша». Фамилия эта довольно редкая, её географическое распространение невелико, что неудивительно для прозвища, связанного с архаичным понятием. Встречается она преимущественно в центральных и северных областях России — там, где следы дохристианской культуры сохранялись в языке и топонимике дольше всего.