Фамилия Капишин — наглядный пример того, как в русской фамилии может законсервироваться редкое или устаревшее слово. В основе, скорее всего, лежит неканоническое имя или прозвище Капиш. Это слово в диалектах имело два значения. Первое — «капюшон», «шапка с ушами» или «башлык» (от тюркского «кап» — мешок, чехол). Второе, менее очевидное — «коптилка», «светильник с фитилём» (от глагола «капать»). В обоих случаях прозвище могло быть профессиональным: так могли назвать портного, мастера по головным уборам или, что менее вероятно, торговца масляными лампами.

Словообразовательная модель простая: суффикс -ин указывает на принадлежность. Капишин — «сын Капиша» или «человек из семьи Капиша». Такая модель типична для прозвищ и мирских имён, оканчивающихся на твердый согласный (ср. Фомин, Никитин). В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от полных церковных имён, -ин нередко цеплялся за прозвища, диалектные слова и уменьшительные формы.

Встречается фамилия преимущественно в центральных и северных областях России, где диалектное слово «капиш» (капюшон) было в ходу. В ономастических справочниках эта фамилия не относится к числу распространённых, что делает её интересной для локальной истории: носители, скорее всего, ведут род из одного или нескольких соседних сёл, где прозвище закрепилось за конкретной семьёй.

Путать с фамилией Капитонов не стоит — та образована от церковного имени Капитон (от лат. capito — «головастый»). Капишин стоит особняком: его корень уходит не в святцы, а в бытовую речь, в мир вещей — будь то капюшон или коптилка.