Фамилия Капытин — классический пример русской фамилии, образованной по модели «основа + суффикс -ин». Этот суффикс указывает на принадлежность: Капытин буквально означает «сын Капыты» или «человек из рода Капыты». Основа здесь — прозвище Капыта, которое в русских говорах имело вполне конкретное значение.

В большинстве диалектов «капыта» — это копыто, но не в прямом анатомическом смысле. Так могли прозвать человека с грубой, широкой или неуклюжей ступнёй, того, кто «копытит» землю при ходьбе, то есть тяжело ступает. В некоторых регионах слово «капыта» использовали как прозвище для плотника или сапожника, работающего с твёрдыми материалами — деревом или кожей, — по аналогии с копытом как твёрдой частью ноги. Есть и версия, что прозвище давали за характер: «капытиться» в говорах значило упрямиться, стоять на своём, как лошадь, которая бьёт копытом.

Словообразовательный разбор показывает, что фамилия не могла возникнуть от имени Капитон (тогда была бы форма Капитонов или Капитин с другим суффиксом). Суффикс -ин чётко отсекает вариант с отчеством от церковного имени. Значит, корень — именно прозвищный, бытовой. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, что типично для прозвищ, связанных с внешностью или манерой поведения: такие прозвища давали в любом регионе независимо друг от друга.

Интересная деталь: в старых писцовых книгах XVII века встречаются записи «Капыта Иванов сын» — это не фамилия, а личное прозвище, которое потом закрепилось за потомками. Судя по контексту таких записей, носители прозвища были крестьянами или посадскими людьми, никак не дворянами. Фамилия Капытин не входит в списки столбового дворянства, и это нормально: подавляющее большинство русских фамилий именно крестьянские, образованные от уличных прозвищ.