Фамилия Карачинсков — один из тех случаев, когда форма на -ов скрывает более древнюю фамилию на -ский. Перед нами не прямое прозвище, а вторичное образование: сначала существовала фамилия Карачинский, а от неё, по модели «чей будешь?», возникло притяжательное Карачинсков. Такая модель характерна для крестьянской среды, где сына или внука могли записать по отцу: «Карачинского сын — Карачинсков».

Основа фамилии — географическое прозвище Карачинский, которое связывают с городком Карачев. По преданию, эти земли в 1570 году получил от великого князя Ивана Васильевича князь Иван Федорович Перемышльский-Горчаков. Сам топоним Карачев имеет тюркские корни. Здесь возможны два значения: от «qaracy» («верный слуга, наблюдатель») или от «karaca» («темноволосый, смуглый»). Первая версия выглядит предпочтительнее для названия укреплённого пункта: «карачи» — в тюркской традиции так называли советников и доверенных лиц правителя.

Вполне вероятно, что основатель рода Карачинсковых имел отношение к нетитулованному дворянскому роду Карачинских. Их герб помещён в шестую часть «Общего гербовника дворянских родов Российской империи», что указывает на древнее (до 1685 года) происхождение. Однако фамилия Карачинсков, с её крестьянским суффиксом -ов, скорее всего, принадлежала не самому дворянскому роду, а их бывшим крепостным или однодворцам, которые взяли фамилию по имени владельца. Так что за одной фамилией может стоять и княжеский дар XVI века, и сельская перепись XIX века, где крестьянина записали как Карачинскова — «из людей Карачинского».