Фамилия Каракузова — женская форма мужской фамилии Каракузов. В русской традиции такие фамилии образуются добавлением окончания -а, и по сути это отчество в родительном падеже: «чьих будете?» — Каракузовых, дочь Каракузова. Разбирать её стоит через мужской вариант, потому что именно он хранит историю прозвища или имени.

Основа Каракуз — тюркская, и здесь почти нет споров. Слово «кара» в тюркских языках означает «черный», а «куз» — «глаз». Буквально «черноглазый». Это типичное прозвище по внешнему признаку: так могли назвать человека с темными глазами, смуглого, чернобрового. В тюркской ономастике такие двухосновные прозвища (цвет + часть тела) встречаются часто: Карабаш (черная голова), Карасакал (черная борода). Каракуз — из того же ряда. Прозвище давали не в обиду, а как примету, по которой человека знали в округе.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ и имен. Когда в XVI–XVII веках русские служилые люди, крестьяне и казаки селились рядом с тюркскими народами, они нередко перенимали прозвища соседей или получали их от них. Каракузов — фамилия, которая могла возникнуть в среде русского или крещеного тюркского населения на южных и восточных рубежах России: в Поволжье, на Урале, в Сибири, в казачьих областях. Именно в этих регионах фамилия встречается чаще всего, хотя конкретной географической привязки к одному селу или уезду нет — она разошлась широко.

В русском языке фамилия легко вписалась в стандартную модель: прозвище Каракуз + -ов. Никаких редких суффиксов или исключений. Интересно другое: в отличие от многих тюркских фамилий, которые оканчиваются на -ев (если основа на мягкий или шипящий), здесь твердый суффикс -ов, что говорит о давней русификации. Носители фамилии могли быть как русскими по происхождению (потомками тех, кто получил прозвище от татар или башкир), так и потомками крещеных тюрков, утративших родной язык.

Версия, что Каракуз могло быть личным именем, а не прозвищем, маловероятна: в тюркской антропонимике такие составные имена встречаются, но обычно они имеют сакральный смысл (например, Кара — «черный» как оберег от зла). Однако в русских документах Каракуз фиксируется именно как прозвище, а не как крестильное имя. Так что наиболее правдоподобно: предок носителя фамилии был человеком с черными глазами, и это прозвище закрепилось за его родом.