Фамилия Карапиперова — редкий пример сложения двух основ, где первая часть восходит к тюркскому «кара» (чёрный, тёмный, а в переносном смысле — простой, народный), а вторая — к греческому «пипери» (перец). Такое сочетание, скорее всего, указывает на прозвище, данное человеку по внешности или характеру: «чёрный перец» могли назвать смуглого, жгучего брюнета или, наоборот, человека с острым, «перчёным» языком.

Суффикс «-ова» — типичный русский патронимический показатель женского рода (отвечает на вопрос «чья?»). То есть перед нами форма женской фамилии, образованной от мужской Карапиперов. Сама мужская фамилия построена по продуктивной модели «прозвище + -ов»: сначала человека прозвали Карапипер, а потом его потомки стали Карапиперовыми. Такая модель характерна для южнорусских и украинских земель, где особенно часто встречаются составные прозвища из тюркского и греческого элементов — следствие многовекового соседства с крымскими татарами и греческими поселенцами.

Вторая часть «пипер» указывает на возможную связь с греческой диаспорой Приазовья. В греческом языке «πιπέρι» (пипери) — перец, и это слово могло войти в прозвище напрямую, без тюркского посредничества. Тогда «кара» выступает как усилитель: не просто перец, а чёрный, жгучий. Встречаются и однокоренные фамилии — Пиперов, Перепелов (от «перец»), но Карапиперов выделяется именно двойным корнем.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам — составные прозвища такого типа редко встречаются у дворянства, которое предпочитало фамилии на «-ский» от названий имений. Географически фамилия тяготеет к югу России: Ростовская область, Краснодарский край, Ставрополье. В дореволюционных метрических книгах Карапиперовы встречаются в сёлах бывшей Екатеринославской губернии, где жили греки-румеи.

Сегодня фамилия остаётся крайне редкой. Её носители, вероятно, не знают, что их предок четыре века назад получил прозвище за смуглую кожу или острый язык — и это прозвище закрепилось в роду навсегда.