Фамилия Карапина — женская форма, мужская, соответственно, Карапин. Она образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Карапа. Что оно означало — вопрос неочевидный, и здесь стоит разобрать несколько версий.

Самая прямая и правдоподобная версия связывает Карапу с глаголом «карапать» (или «корябать») — царапать, писать неразборчиво, делать зазубрины. В диалектах слово «карапа» могло означать неумелого писаря, человека с плохим почерком либо того, кто работает грубо, «карябает», а не делает чисто. Такое прозвище могли дать ремесленнику — столяру, плотнику или сапожнику, чья работа оставляла следы, заусенцы. Это объяснение простое и не требует привлечения иноязычных корней.

Вторая гипотеза — тюркская. Корень «кара» (чёрный) в сочетании с суффиксами встречается во многих фамилиях (Караев, Карабаев). Карапа могла быть переделкой тюркского имени или прозвища, где «кара» — «чёрный», а вторая часть неясна. Но для фамилии Карапин эта версия менее убедительна: суффикс -ин характерен для русских фамилий, образованных от основ на -а, и если бы основа была тюркской, фамилия скорее получила бы суффикс -ов (Карапов). Форма Карапин указывает, что прозвище Карапа уже бытовало в русской среде и осмыслялось как славянское.

Есть и редкая диалектная возможность: в некоторых говорах «карапа» — это черепаха (ср. «карапакс» — панцирь, из романских языков). Но это слово узкотерриториальное и вряд ли стало основой для массовой фамилии. Скорее всего, перед нами — прозвище по действию или качеству, а не по животному.

Географически фамилия Карапин встречается рассеянно, без ярко выраженного «гнезда» в одном регионе, что типично для прозвищных фамилий, не привязанных к локальному ремеслу. Встречается она и в украинских, и в белорусских областях, что лишний раз подтверждает её восточнославянскую основу.

Итак, предок носителей фамилии Карапин, скорее всего, получил прозвище Карапа за манеру письма (писарь-«каряка») либо за неаккуратную работу руками. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, и её носители — люди, чью историю можно восстановить по писцовым книгам и ревизским сказкам, где упоминаются крестьяне с таким прозвищем.