Фамилия Карапота — редкая и неочевидная. Чтобы понять её происхождение, нужно отбросить привычную модель «отчества на -ов/-ев». Здесь работает другой механизм: основа, скорее всего, прозвищная, а суффикс — уменьшительный или уничижительный. Разбираем слово по частям.

Корень «карап-» явно не славянский. Самая вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках «кара» означает «чёрный», а «пот» или «потa» — «глаз» или «глаза» (ср. татарское «күз» — глаз, но в диалектах возможны варианты). Таким образом, «Карапота» могло быть прозвищем человека с тёмными глазами — «черноглазый». Это логично: такие внешние признаки часто становились уличными кличками, которые потом закреплялись в документах.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с диалектным словом «карапот» — так в некоторых южнорусских говорах называли неуклюжего, неповоротливого человека, увальня. Если это так, то фамилия образована напрямую от прозвища без дополнительных суффиксов, что для русских фамилий редкость, но встречается (ср. Кривошея, Голова).

Суффикс «-а» в конце — типичное русское окончание, которое адаптировало иноязычную или диалектную основу по образцу слов женского рода (как «сирота», «слуга»). В украинской ономастике такой тип тоже встречается, но там фамилии на «-ота» (Босота, Голота) чаще указывают на состояние или качество.

Географически фамилия Карапота тяготеет к югу России и Украине, особенно к регионам, где было сильное тюркское влияние — Кубань, Ростовская область, Запорожье. В списках казачьих родов эта фамилия не зафиксирована, но её звучание вписывается в казачью среду, где прозвища из тюркских языков были обычным делом.

Сословная принадлежность предков не прослеживается по самой фамилии: Карапота мог быть и крестьянином, и мещанином, и казаком. Единственное, что можно утверждать — фамилия не дворянская, так как не использует суффиксы «-ский» или «-ов» в типичной знатной модели.

Итог: Карапота — скорее всего, прозвище по внешнему признаку («черноглазый») или по характеру («увалень»), закрепившееся на юге России. Точное значение теряется в диалектах, но тюркский след — самый надёжный.