Фамилия Карганян — типичный пример армянской родовой фамилии: суффикс -ян (в диалектах также -янц) означает принадлежность к клану, то есть «из рода Карган». Вопрос в том, что скрывается за основой Карган, и здесь у исследователей нет единого мнения.

Самая прямая версия отталкивается от тюркского слова garyjan («состарившийся»). В таком случае прозвище Карган давали пожилому, уважаемому человеку, основателю рода. Однако есть и иная, бытовая трактовка: от тюркского «карган» — «густая трава». Тогда прозвище могло указывать на место жительства предка, например, на заросший бурьяном участок.

Не менее интересна версия, которую поддерживал исследователь Ю. А. Федосюк. Он считал, что Карган — это стяженная форма слова караган («степная лисица»). В этом случае прозвище носило иносказательный характер: так могли назвать хитрого, ловкого человека, обладающего повадками зверя. Эта гипотеза выглядит правдоподобной, учитывая, что прозвища от названий животных в армянской и тюркской среде были распространены.

Существует и более сложная версия, связывающая фамилию с восточным именем Карахан. Оно составное: «кара» (тюрк. «черный», но также и «слепой») и «хан» («князь, монарх»). Имя Карахан — «черный хан» — могло принадлежать знатному предку, а его фонетический вариант Карган со временем закрепился как родовое имя. Некоторые ученые добавляют, что «кара» в значении «слепой» могло указывать на реальную трагедию: предка из местного княжеского рода ослепили в бою с турками.

Все эти версии, при всей их разнице, сходятся в одном: фамилия Карганян — не случайный набор звуков, а след, ведущий либо к профессии, либо к личному качеству, либо к социальному статусу. Выбрать одну из них без дополнительных генеалогических данных сложно, но ясно, что носители фамилии принадлежат к древнему роду, чья история уходит корнями в тюрко-армянское пограничье.