Фамилия Каркарин образована от прозвища Каркара. По одной из версий, оно происходит от глагола «каркать». Согласно другой версии, прозвище Каркара восходит к турецкому car car, что в переводе на русский язык означает «громко, шумно разговаривать». В этом случае прозвище Каркара мог получить громкоголосый человек. Существует также версия, по которой фамилия Каркарин восходит к гидрониму Каркара — это соленая речка в Туркестанском крае, к востоку от озера Иссык-куль. Поэтому не исключено, что прозвище Каракара указывало на место жительства предка Каркариных: вероятно, он жил в долине этой реки. Наконец, есть вероятность того, что прозвище Каркара связано с западнославянским «карк», т.е. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Каркара, со временем получил фамилию Каркарин.