Фамилия Карликанова, скорее всего, женская форма от Карликанов, а её основа — прозвище Карлик. В русской традиции прозвища, данные по внешним признакам, были обычным делом: низкорослого, очень маленького человека могли прозвать Карликом. Дети и потомки такого человека получали фамилию Карликановы — то есть «чьи?» — Карликановы. Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или мирских имён, и указывает на принадлежность роду.

Интересная деталь: в русском языке слово «карлик» — заимствование из немецкого (Zwerg через польское karzeł или чешское trpaslík, но в форме «карлик» — из немецкого Kärl, что значит «маленький человек»). Однако в народной среде прозвище могло быть не только обидным, а просто констатирующим факт — так называли невысокого крестьянина, ремесленника или солдата. В документах XVI–XVII веков встречаются записи о людях с прозвищем Карлик, например, в писцовых книгах Новгородской земли упоминается крестьянин Карлик Ондреев. Фамилия, соответственно, могла закрепиться в тех же регионах — на севере и северо-западе России, где велась активная перепись населения.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: фамилия могла произойти от тюркского имени или прозвища, где корень «карлы» означает «снежный» (ср. татарское «карлы» — «снежный»). Но в таком случае форма была бы Карлыканов, а не Карликанов, и суффикс -анов указывал бы на восточное происхождение. Однако для фамилии Карликанова такое объяснение натянутое: звучание ближе к русскому «карлик», чем к тюркскому корню.

Носители фамилии сегодня встречаются в центральной России и Поволжье, но численно она редкая. В ревизских сказках XIX века Карликановы записаны в основном среди государственных крестьян — то есть свободного, но небогатого сословия. Никаких дворянских корней у фамилии нет, что типично для прозвищных образований. Если ваша фамилия — Карликанова, то предки, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище за рост, и это прозвище закрепилось как родовое имя.