Прозвище Карнак, вероятно, восходит к глаголу «корнать», то есть «обрезывать, остригать, укорачивать». Можно предположить, что предок обладателя фамилии Карнаков был, например, портным или парикмахером. Однако, в некоторых диалектах бытовало однокоренное слово «корный» - «малорослый, низкий, короткий». Следовательно, Карнаком могли прозвать и приземистого, невысокого человека. Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Карнак относится к числу так называемых «семинарских» фамилий. В таком случае фамилия образована от топонима Карнак. Карнак — это название египетской деревни, расположенной в двух с половиной километрах к северу от Луксора, на месте древнеегипетских Фив. Она занимает примерно половину территории великого храма Амона — Ипет-Исут, который начал строиться в XX веке до нашей эры и служил основным государственным святилищем на протяжении всей истории Нового царства. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Карнак, со временем получил фамилию Карнаков.