Фамилия Кашликов образована от прозвища или мирского имени Кашлик, и у этой основы есть как минимум две версии происхождения, причём обе ведут в разные стороны — и по смыслу, и по географии.

Первая версия отсылает к белорусскому прилагательному «кашлаты» — лохматый, мохнатый, волосатый. Если так, то прозвище Кашлик могли дать человеку с длинными, густыми, непослушными волосами. В крестьянской среде густые волосы считались не только признаком красоты и здоровья, но и вместилищем жизненной силы: в старину верили, что если хотя бы один волос попадёт в руки недоброжелателя, человек может заболеть или потерять удачу. Прозвище в таком случае было чисто описательным, без охранительного подтекста.

Вторая версия — «кашель». Слово «кашлик» как уменьшительная форма от «кашель» могло стать мирским именем, которое выполняло обережную функцию. Родители, желая уберечь сына от болезней и сглаза, нарекали его Кашликом — как бы «от противного», чтобы злые силы не позарились на здорового ребёнка. Такая практика давать детям «плохие» имена (Некрас, Нелюб, Кашлик) была распространена у восточных славян: считалось, что имя-оберег отводит беду.

С точки зрения словообразования фамилия построена по стандартной модели: основа Кашлик + суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Кашликов). Значит, предок носителя фамилии — человек по прозвищу или имени Кашлик. Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на твёрдый согласный.

Спор между версиями разрешается в пользу «кашлатый», если учитывать географию. Фамилия Кашликов встречается в основном в южнорусских и белорусских регионах, где слово «кашлатый» было в ходу. Версия с «кашлем» слабее: она не подкреплена диалектной лексикой, а «охранительные» имена от названий болезней встречаются реже, чем от абстрактных или бытовых понятий.

Таким образом, скорее всего, Кашликов — потомок лохматого человека из белорусских или смоленских земель. Но не исключено, что фамилия когда-то была оберегом, защищавшим от хвори.