Фамилия Казаченок (и её вариант Казачёнок) — типичный пример восточнославянской фамилии с уменьшительным суффиксом. Модель образования проста: к основе «казак» или «казач-» добавили суффикс -ёнок/-енок, который в белорусской, украинской и южнорусской традиции означал «сын такого-то» или «молодой, малый». Буквально Казаченок — это «сын казака» или «маленький казак».

Однако прямое прочтение не всегда верно. Фамилия действительно могла закрепиться за сыном человека, носившего прозвище Казак, но само прозвище не обязательно указывало на службу в казачьем войске. На Русском Севере, где казаков исторически не было, слово «казак» имело другое значение — наёмный работник, батрак. Поэтому предок Казаченок мог быть вовсе не военным, а подёнщиком.

Корень фамилии — тюркского происхождения. Слово «казак» (qazaq) в тюркских языках имеет целый веер значений: «скитаться, бродить», «смелый, проворный», «зверь, отбившийся от стада», «неженатый, холостой человек». Все эти смыслы так или иначе описывают свободного, независимого человека, не привязанного к дому или общине. Именно это внутреннее содержание — «вольный, самостоятельный» — и могло лечь в основу прозвища, независимо от рода занятий.

Вариант написания через «ё» — Казачёнок — указывает на ту же модель, но с ударением на последний слог. В русских говорах и документах XIX века написание могло колебаться, так что обе формы по сути — одна фамилия.

Географически фамилия Казаченок встречается не только на юге, где казачество было сословием, но и в белорусских и северорусских областях. Это как раз подтверждает вторую версию происхождения — от прозвища по роду работы или по характеру, а не по сословной принадлежности.