Фамилия Казанкина — одна из тех, что отсылают к географическому имени, но не напрямую, а через прозвище. В основе лежит прозвище Казанка. Так в старину могли назвать человека, который пришёл из Казани или имел с этим городом прочную связь: торговал там, часто бывал по делам или переехал оттуда на новое место. Казанка — типичное прозвище «по месту прежнего жительства», которых в русской ономастике много (Москва, Тверитин, Рязанец).

Название города Казань, по самой распространённой версии, восходит к татарскому «казан» — котёл. Легенда связывает это с тем, что город был основан на месте, где в реке нашли котёл. Впрочем, есть и другие гипотезы, но связь с тюркским словом остаётся основной. Археологические находки на территории казанского Кремля, в том числе чешская монета времён святого Вацлава (предположительно 929–930 годов), подтверждают древность поселения, но к самой фамилии это имеет лишь косвенное отношение: она моложе на много столетий.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Казанкина — буквально «дочь (или жена) Казанки». Такая модель характерна для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я. Фамилия Казанкина встречается не повсеместно, а преимущественно в регионах, куда шли миграционные потоки из Поволжья: в Зауралье, Сибири, на Урале. Там, где в XVII–XIX веках оседали выходцы из казанских земель, эта фамилия и закрепилась.